Nueve esqueletos humanos completos y numerosos restos óseos fueron encontrados en el antiguo Hospital de San Roque, durante el proyecto de salvamento arqueológico que realiza el Instituto Nacional de Antropología e Historia (INAH) por lo que que algunos de los restos fueron hallados en una fosa común y otros más muestran episodios violentos, siendo uno de ellos el caso de un hombre que murió entre los 40 y 45 años de edad y que presenta dos lesiones en la región central del hueso frontal.
De acuerdo con personal del INAH, el cráneo no muestra evidencias de recuperación ósea, de tal forma que el par de heridas habrían provocado la muerte del individuo por traumatismo craneoencefálico por lo que también destacan los restos de dos mujeres que fueron localizados en distintas unidades de excavación mismos que tenían huesos de neonatos con diversos estados de gestación en las costillas.
Hasta el momento no se puede hacer referencia a un panteón o a un lugar específico para depositar los cadáveres y aunque la mayoría de los restos son de la época virreinal, algunos podrían corresponder al siglo XX, sin embargo lo llamativo es que no se han encontrado ataúdes, clavos u otros indicios de que los cuerpos recibieron cristiana sepultura, sino que han sido hallados debajo de los pisos en patios, cuartos, detrás de escaleras o arranques de columnas. Cabe hacer mención, que el Hospital de San Roque data del siglo XVI y se creó para atender a los españoles que venían al nuevo mundo, ya que Puebla era un punto medio entre Veracruz y la capital de la Nueva España, aunque cerró sus puertas el siglo pasado.