Con más de seis años en construcción, el hoy ya en operaciones, Tren interurbano México-Toluca ha tenido un costo calculado de 103,000 millones de pesos, un 173% más a lo estimado durante la administración de Enrique Peña Nieto, cuando se calculó en 38,000 millones de pesos.
El precio de esta obra, resulta un 17.6% más alto que el del Aeropuerto Internacional Felipe Ángeles y 6% más que el Tren Maya, otra de las grandes obras de esta administración, esto según cifras de un estudio realizado por el experto en combate a la corrupción, Max Kaiser.