La Aduana y el Puerto de Manzanillo serán manejados por la Secretaría de Marina Armada de México, lo anterior, debido a que, al ser el más importante del país y de los tres principales en América Latina, lo convierte en uno de los principales conductos para el tráfico de drogas, así lo anunció el presidente de México, Andrés Manuel López Obrador, durante su gira de trabajo por el estado de Colima.