Ante las críticas de diversos partidos políticos por considerar que el PREP de Jalisco fluyó demasiado lento en comparación con el federal, el vocal ejecutivo del INE en el estado, Luis Zamora Cobián defendió que esto fue debido a la complejidad de contar los votos de dos coaliciones con gran participación de partidos políticos.
"No vale comparar el registro que tuvimos del PREP en el INE al PREP del IEPC, porque la coalición con cinco partidos genera 31 modalidades del ejercicio del voto, entonces, no es lo mismo capturar lo de siete modalidades contra 31 modalidades, no digo que sea la razón, sino que hay una diferencia a considerar, no es lo mismo capturar lo de siete campos a 31 campos, y además, no va la imagen en el sistema en automático acomodando por líneas, es un ejercicio visual y manual de quien está en la captura tratando de seguir en pantalla la fila que corresponde."
Ante las manifestaciones en algunos consejos, sobre todo en las elecciones estatales, el titular del INE en Jalisco hizo un llamado a la cordura, al respeto y un acompañamiento, pero propositivo.
Ante la polarización que se ha generado, el funcionario electoral recordó que justo para eso existen los cómputos distritales, para empalmar los resultados del PREP con los conteos en las sedes de los consejos y que exista certeza sobre las cifras.