En los muelles de Administración de Sistema Portuario Nacional de Guaymas se encuentran 3 buques operando de manera simultánea uno es el buque de portacontenedores en la ruta regular de Guaymas y manzanillo con carga que viene al estado y proveniente de Asia, hay un buque desembarcando tanques que serán transportados a ciudad de Hermosillo y un buque cargando un concentrado de cobre, proveniente de las minas del norte de sonora y va con destino a china. Al día de hoy, el Puerto a movilizado aproximadamente 2 millones de toneladas de carga diversa principalmente minerales y granos de exportación
El movimiento de carga continua de manera estable, se opera el granel mineral y el granel agrícola principalmente trigo de exportación de los valles de sonora con destino al Mediterráneo y Europa.