El viejo panteón de San José está en el olvido, este fue fundado en 1701 por la misión de San José de la Laguna.
Actualmente no queda casi nada del panteón ya que la mayoría de las tumbas fueron saqueadas al pensar que había riqueza en ellas. San José cuenta con un segundo panteón que fue habilitado en 1825 cuando se decretó el municipio de San José ubicado a un costado de la carretera del libramiento San Judas, mismo que se mantiene sin inversiones actualmente.