La fundación de San Carlos como Comisaría se dio oficialmente el 28 septiembre de 1963 durante el mandato del gobernador Luis Encinas, después de que el desarrollador Rafael Caballero Corral llegará al lugar para crear una comunidad y a su vez un desarrollo turístico, hoy en día San Carlos Nuevo Guaymas cuenta con el título de Pueblo Mágico, aunque para que esto sucediera el camino no fue fácil, la historia se divide en tres etapas señaló Ariel Gaspar, residente y prestador de servicios quien señaló los años 70?s e inicios de los 80?s fueron cruciales para que se realizara la proyección a futuro, mismo que por mucho se ha superado
"Los norteamericanos empiezan a venir con más frecuencia y ahí es donde se consolida ya San Carlos como una proyección a futuro, empezaron a desaparecer los trailers park pero llegan nuevos hoteles, abren marinas y lo planeado como un pueblo de residentes se convierte en un pueblo escénico"
Contar con espacios de descanso, diversión, maravillas naturales y hechas por el hombre es sin duda algo de que sentirse orgullosos indicó, haciendo hincapié en que las zonas residenciales que en su momento pertenecieron a los fundadores hoy son habitadas por las segundas o terceras generaciones, dándole un nuevo aire a San Carlos, por lo que las expectativas de desarrollo para el destino son muy altas, siendo considerado uno de los lugares favoritos para visitar dentro del estado de Sonora
"Los 60 años de San Carlos la visión que tuvieron los fundadores se está logrando, creo que no había visto tanta unión como la que estamos viendo ahora, creo que San Carlos está para convertirse después de Mazatlán como un destino preferido"