Anualmente encargados de las instituciones de protección civil, autoridades municipales, corporaciones policiales,unidades de emergencia y representaciones de grupos empresariales sector educativo, toman protesta en el comité municipal de Protección Civil con el fin de prevenir incidentes en la temporada de lluvias lo que incluye un protocolo de limpieza de arroyos, desazolve de la red de alcantarillado y reparación de los bordos de contención en el Valle de Guaymas.
Con el protocolo además de lo primordial que es tener un plan previo a las lluvias y comprometer la participación de todos los sectores, le permitirá al municipio de Guaymas, que tiene el récord de precipitación pluvial con 712 milímetros con la Tormenta tropical Jimena, el 2009, podrá acceder en caso de emergencia, al Fondo de Desastres Naturales para atender a familias vulnerables e infraestructura en la ciudad.
El atlas de riesgo contempla 25 arroyos de una longitud de entre 600 metros y 3.6 kilómetros, localizados en diferentes puntos de Guaymas, son considerados como de alto riesgo a inundaciones para los habitantes que viven en los alrededores de estos.
Cabe mencionar que Guaymas cuenta con los centros comunitarios de la colonia Popular, Mirador, 23 de marzo y Fátima están habilitados como albergues, con colchonetas, cobijas, agua y kits de limpieza, para poder atender a las personas que lleguen a refugiarse, con capacidad para 50, 70 y 100 personas respectivamente y todos ubicados en áreas identificadas como de riesgo por paso de arroyos.