En 2 años con los enfranjados, el campeón del mundo Sub-17 en 2011 tuvo un paso muy difícil con "La Franja"
Aunque llegó a Puebla con muchas expectativas por el talento demostrado con la selección mexicana Sub-17, dónde quedó campeón en el ya lejano 2011, el mediocampista Jhonatan Espericueta tuvo un paso muy gris con el equipo de la angelópolis, con el que solamente logró tener solamente 336 minutos, ya que tuvo 3 partidos de titular y entró de cambio en 5 encuentros más, es puntual mencionar que este lapso el jugador tuvo 2 lesiones fuertes, ya que año pasado sufrió una fractura de peroné y al inicio de estebaño una ruptura de ligamentos.
Relegado por Ricardo "El Tuca" Ferreti en Tigres, Espericueta jugó 28partidos de liga y un encuentro en la Copa MX con el Club Atlético San Luis, llegó al Puebla para el torneo Apertura 2018, y hasta la fecha sólo participó en tres encuentros de Titular en la Liga MX y 7 en la Copa MX, Espericueta Escamilla tuvo sus últimos minutos con la playera del Club Puebla en el torneo Clausura 2019, dónde jugó 3 encuentros con la categoría Sub-20 sin anotar ningún gol.