El tren México-Querétaro tendrá un total de 5 estaciones saliendo desde Huehuetoca, para posteriormente llegar a Tula. A su vez la siguiente parada ya en el estado será San Juan del Río, y después se prevé tener otra parada en el Aeropierto Internacional de Querétaro (AIQ) la cual se definirá en la zona de Los Héroes. Por último, la estación final estará en Querétaro, donde se ha definido que termine la obra de infraestructura, que se espera concluir en 2027.
