Desde el inicio de la contingencia, las estadísticas que han manejado las autoridades estatales y federales no han coincidido, ambos cuentan con plataformas diferentes que ha llevado incluso a que gobernadores señalan al gobierno de Andrés Manuel López Obrador, a que estaban manejando cifras equivocadas en cuanto a casos positivos y a las muertes de los infectados.
La actualización de ambos portales es muy diferente, pues a pesar que el del Gobierno Estatal, los datos son limitados la actualización es tardía y los fines de semana dejan de subir información, dejando 3 días sin registrar movimiento, por lo que a diferencia del portal Covid-19 México, esta se actualiza por las noches todos los días.
En el portal del Gobierno Estatal, el cual inicia el registro el día 03 de marzo a la fecha establece que Tehuacán, que está dentro de la lista de los 103 municipios poblanos infectados, 30 casos positivos y 9 defunciones, según su última actualización el pasado 21 de mayo, sin embargo, la página del Sistema nacional de Epidemiología del Gobierno Federal Covid-19 México, las estadísticas son diferentes, los casos positivos son 54, mientras que en personas fallecidas es de 8.
Si comparamos ambos portales, el número de conformados de Covid-19 es prácticamente al doble, una diferencia de 24 casos más reporta la federación a comparación de las estadísticas estatales llegando casi al doble, por lo que generan una confusión en cuanto a la realidad que se vive en este municipio, puesto que además a nivel local, los encargados de la jurisdicción sanitaria evitan emitir datos.