Baja California Sur se encuentra entre los principales productores pesqueros del país. Según la Comisión Nacional de Pesca (CONAPESCA), en su Avance mensual de producción pesquera, en el 2018 fue el tercer estado con mayor producción, detrás de Sonora y Sinaloa, con más de 191 mil toneladas de pesca, lo que representa casi el 9% de la producción total del país.
En su flota cuenta con 4,372 embarcaciones menores. Así lo indica el Registro Nacional de Pesca y Acuacultura.
Destacan en la producción, por su volumen, la sardina, la almeja, la cabrilla y el camarón.