Un 24 de junio de 1997 fue inaugurado el centro interdisciplinario para el desarrollo integral regional unidad Sinaloa por el entonces presidente de la república el doctor Ernesto Zedillo Ponce de León, sin embargo, el primer paso en la concepción del CIIDIR Sinaloa se dio en 1993, con la firma del convenio de colaboración entre el Instituto Politécnico Nacional y el H. Ayuntamiento de Guasave, en presencia de representantes de sectores productivos, gobierno e instituciones educativas.
Los argumentos principales de su creación fueron la necesidad de llevar a cabo la investigación básica, aplicada y desarrollo tecnológico capaz de brindar apoyo a las actividades productivas de la región, así como el brindar alternativas de manejo sostenible para tales actividades productivas.
Hoy el CIIDIR está de manteles largos al cumplir 25 años de trabajo científico en nuestra región, ante esto, el director de la institución Juan Carlos Sáenz, el reto ya no es solo el de la investigación, sino el de vincularlo con el sector productivo, detalló que dentro de los muchos logros realizados durante este tiempo están el de cuatro patentes, además de múltiples artículos científicos reconocidos a nivel mundial en el tema agropecuario.
En el marco de los festejos del 25 aniversario de la institución, el CIIDIR Sinaloa contó con la presencia de la Secretaria de Investigación y Posgrado del Instituto Politécnico Nacional Laura Arreola Mendoza, quien señaló que actualmente el Instituto Politécnico Nacional tiene presencia prácticamente en todas las entidades de nuestro país, detalló que la institución ha logrado insertarse de manera importante para ser un apoyo para el crecimiento no solamente en la región de Guasave, sino del estado y otros de la república que forman parte de la región.
La investigadora señaló que actualmente el CIIDIR se encuentra centrado en los temas de seguridad alimentaria y lo relacionado al desarrollo sostenible y el cambio climático, ejes fundamentales y críticos, creando impacto en el desarrollo de líneas de investigación relacionados con el desarrollo económico y social de la región.