La Secretaría de la Defensa Nacional cumple con diversos roles en el municipio de San Cristóbal de las Casas, por un lado, se encarga de la vigilancia de los filtros sanitarios instalados por las autoridades de salud para evitar la propagación del virus SARS-COV-2, así mismo realiza la entrega de apoyos a personas que fueron vulneradas por el paso de la tormenta tropical Cristóbal.