Los aranceles también causarán afectaciones en el sector primario, sobre todo a los productores de nogal, naranja, tomate, nuez y horticultores. En el sur de Sonora el Sistema de Producto Tomate, Sistema de Producto Nogal, entre otras, serían las principales afectadas con aranceles de mayor costo, ya que actualmente son las que exportan.
Por otro lado, según Mario Pablos, presidente del Distrito de Riego del Río Yaqui, el sector agrícola como el trigo, maíz o garbanzo no se tiene previsto que se vean afectados ya que la producción es para nivel nacional y no se exporta a otros países