De acuerdo con la Conanp, en México existen 38 reservas de la biósfera, 68 parques nacionales, 4 monumentos naturales, 7 áreas de protección de recursos naturales, 29 áreas de protección de flora y fauna, y 17 santuarios. Todas amenazadas por distintos factores; el narco, la tala ilegal, los megaproyectos, como el polémico, Tren Maya. Este Megaproyecto es uno de los que más presupuesto recibe del gobierno Federal, ya que este es uno de los proyectos de inversión insignia de la administración de AMLO, quien ha impulsado esta obra a pesar de no contar con la aprobación de diferentes sectores sociales, principalmente los habitantes de la zona que serán desplazados. Sin embargo, grupos no gubernamentales advierten que esto tendrá un impacto negativo en la flora y fauna del lugar, ya que recientemente, el Fondo Nacional de Fomento al Turismo (Fonatur) dio a conocer que los primeros tres tramos del plan carecen de revisión de impacto ambiental. Por su parte, el secretario de Medio Ambiente, Víctor Manuel Toledo ya salió a decir, que quienes critican estos recortes presupuestales son políticos que se han beneficiado con negocios verdes, puesto que ninguna secretaría se salvó de actos de corrupción durante los sexenios prianista y, la Conanp tampoco fue la excepción. A través de la cuenta de twitter @SalvemosCONANP algunos integrantes del organismo señalaron que el decreto del 75% al recorte presupuestal, se mantiene por parte del gobierno federal, lo que limitara sus capacidades para atender la Biosfera del Pinacate, pero señalan que continuaran con su preservación a pesar de las limitantes. El pasado 3 de junio, el Centro Mexicano de Derecho Ambiental (CEMDA) publicó en su portal oficial, un boletín en el que detalla que México ha sufrido un 86% de recorte presupuestal para la protección de Áreas Naturales Protegidas (ANP), lo cual ha debilitado la capacidad de gestionar estas áreas de manera adecuada. En la publicación "Cuidar lo que importa" redactada por las organizaciones que conforman el grupo NOSSA, se hace un análisis del presupuesto asignado para las ANP y señalan que estos espacios, brindan una cantidad de bienes y servicios a las comunidades, ya que, de acuerdo a un análisis en 2008, se estimó que, por cada peso invertido para su protección, estos aportaron 52 pesos para la economía nacional. Es decir que el buen manejo de las áreas naturales Protegidas, es una inversión redituable, sin embargo, la política de austeridad del actual gobierno federal, está poniendo en peligro el medio ambiente de México. Ya que la CONANP, no contara con recursos para gastos de operación, como renta de oficinas, gasolina o viáticos, lo que también afectara en gran medida el trabajo del guarda parques y consultores técnicos. El no contar con recursos necesarios, significa no poder llevar a cabo, actividades esenciales como monitoreo biológico, vigilancia, supervisión de actividades recreativas, reforestación, generación de conocimiento y educación ambiental. El recorte, también afectara el combate a los incendios forestales y a la propagación de plagas en las 182 áreas protegidas que cubren el 11% de la superficie terrestre y el 22 % de la superficie marina.