En el Ayuntamiento de Juchitán existen tres sindicatos reconocidos por la Autoridad Municipal, los cuales son el Sindicato Único de Trabajadores del Ayuntamiento de Juchitán (SUTAJ), el Sindicato Víctor Yodo y el Sindicato Hermanos Flores Magón, además de otras agrupaciones independientes que laboran para esta administración en turno.
La Secretaria General del SUTAJ, María Elena Velázquez Aquino, informó que los agremiados de este gremio están en pláticas para poder trabajar con la próxima autoridad municipal, respetando las plazas con las que cuenta, que alrededor de 100.