De los 28 parques eólicos instalados en el Estado de Oaxaca desde hace más de 20 años, solo uno tuvo un proceso de Consulta Indígena ante la demanda de grupos opositores a los megaproyectos, sin embargo han existido denuncias de presuntas violaciones al tratado internacional del Convenio 169 de la Organización Internacional del Trabajo (OIT) que establece que los pueblos deben ser consultados, informados y sus derechos deben ser respetados.
Desde el año 2013 un grupo de habitantes de Juchitán, Oaxaca, autodenominados Asamblea del Pueblo Juchiteco (APJ), presentó un Juicio de Amparo ante el Juzgado Séptimo de Distrito con sede en Salina Cruz, en contra la instalación del parque eólico Bi Hioxho de la empresa Gas Natural Fenosa, debido a que no se había consultado a la comunidad. Además en el 2015 iniciaron el proceso de un amparo en contra de la Consulta Indígena donde se aprobó la instalación del parque Bi Nisa, de la empresa Eólica del Sur, sin embargo ambos amparos no prosperaron y los parques operan con normalidad.
"Ese proceso de amparo que interpusimos pues contra la consulta porque no llevaron a cabo ninguna consulta indígena, y contra el despojo porque son tierras comunales, es decir, que los jueces hasta la fecha han dado a entender que están a favor de las empresas transnacionales, porque no han tomado en cuenta a la comunidad indígena , no han tomado las leyes, no han tomado en cuenta las leyes agrarias, ni las leyes indígenas, y bueno sobre el otro amparo justamente estamos valorando cuando llevar ese amparo, ese juicio a la Comisión Interamericana de Derechos Humanos", dijo Mariano López Gómez, integrantes de la APJ
A mediados de agosto del año 2018, la Suprema Corte de Justicia de la Nación le negó un amparo a la Asamblea de los Pueblos Indígenas en Defensa de la Tierra y el Territorio del Istmo de Tehuantepec, Oaxaca, para que se suspende la licencia de construcción del parque eólico de la empresa Eólica del Sur, ya que los jueces determinaron que sí se llevó a cabo la Consulta Indígena previa, libre e informada.
En lo que respecta a la comunidad de Unión Hidalgo, Oaxaca, también se ha presentado la oposición de un grupo de habitantes, quienes han tenido que recurrir a instancias internacionales para presentar una denuncia en contra de la empresa eólica EDF, al considerar que se ha incurrido en violaciones a los derechos de la comunidad indígena, para la instalación del parque eólico Gunaa Sicarú.
"Demandamos como comunidad a la empresa EDF allá ante los tribunales franceses, esto lo hicimos porque en el Estado Francés, existe una norma, hay una ley de vigilancia que obliga a que las empresas de esa nación tengan que respetar los derechos humanos en donde quiera que instalen cualquier proyecto que sea de gran envergadura", explicó Norberto Altamirano Zárate, vocero de los Comuneros de Unión Hidalgo, Oaxaca.
En el Istmo de Tehuantepec, se encuentran establecidos actualmente unas mil 500 turbinas eólicas en los 17 parques eólicos que son La Venta I, II y III, Parque Ecológicos de México, Eurus fase I y fase II, Bii Ne Stipa I, II y III, La Mata- La Ventosa, Fuerza Eólica del Istmo I y II, Oaxaca I, II III y IV, Piedra Larga fase I, Bii Ioxho, Bi Nisa y el de la Fuerza Aérea número 2.