A pesar de que la Defensoría de los Derechos Humanos del Pueblo de Oaxaca, publicó el 27 de agosto de 2014 una Alerta Temprana y el 21 de marzo de 2017 la Comisión Nacional de los Derechos Humanos emitió una Recomendación, para sanear los ríos Atoyac y Salado, incluso, de una sentencia de amparo, no se ha hecho nada, por el contrario, el problema se ha agravado, particularmente en los últimos años.
Así lo señaló la diputada Liz Concha, quien recalcó que la contaminación del Río Atoyac por la descarga deliberada de aguas residuales que hacen los municipios desde el Valle de Etla y hasta Zaachila, tiene ahora un foco rojo que está provocando daños que pueden resultar irreversibles. Señaló que la acumulación de miles de toneladas de basura que todos los días se hace en sus márgenes y particularmente en la zona de la Central de Abasto, que en los hechos se ha habilitado como sitio de transferencia de basura sin contar con los requerimientos mínimos de protección al medio ambiente, agrava más esta problemática.
Desde la más alta tribuna, el Congreso de Oaxaca, la Diputada local por el Distrito 04 con cabecera en Teotitlán de Flores Magón, denunció las anomalías que se presentan en esta importante afluente. La Presidenta de la Comisión de Gobierno y Asuntos Agrarios reconoció que en los últimos meses se ha venido enfrentando un serio problema con el manejo y la disposición final de residuos sólidos urbanos, sin embargo aseveró; "bajo ninguna circunstancia eso puede justificar que los márgenes del Río Atoyac se hayan convertido en un tiradero a cielo abierto generando un grave foco de contaminación de toda la zona, pero que, además, está provocando daños al medio ambiente que nos puede llevar décadas resolver, es inconcebible que hasta ahora ni las autoridades federales ni las estatales ni mucho menos las municipales, hayan hecho algo para resolver el problema, por el contrario, tan solo en la última semana se presentaron tres incendios que más bien parecen haber sido provocados para disminuir la cantidad de basura que ahí se ha depositado".
Subrayó Liz Concha que a pesar de que la Procuraduría de Protección al Ambiente del Estado de Oaxaca (PROPAEO) inició procedimientos administrativos contra el municipio de Oaxaca de Juárez por la disposición inadecuada y no autorizada de residuos sólidos en lugares no adecuados, incumpliendo con la Norma Oficial Mexicana en la materia, que establece los lineamientos específicos para la selección del sitio, diseño, construcción, operación, monitoreo, clausura y obras complementarias de un sitio de disposición final de residuos sólidos urbanos y de manejo especial, a la fecha el problema persiste, y no sabemos sobre consecuencias legales o responsabilidades administrativas que hayan derivado de ese procedimiento.