Avanza el caso del desfalco a la Universidad Autónoma de Nayarit en 2016. A días de que Milton "N" "N" fuera vinculado a proceso por ejercicio indebido de funciones, peculado y enriquecimiento ilícito, la Fiscalía General del Estado consiguió el auto de vinculación a proceso en contra de José Ernesto "N" "N", también por los delitos de peculado, ejercicio indebido de funciones y enriquecimiento ilícito, derivado de la recepción de 107 millones de pesos, propiedad de la UAN sin que se acrediten los fines institucionales, ni justificación del aumento desmedido de su patrimonio, en su carácter de servidor púbico, como vigilante de la máxima casa de estudios, todo ello durante el ejercicio fiscal 2016.
De igual forma se vinculó a proceso María "N" "N" por los delitos de ejercicio indebido de funciones y peculado, por desviar a su cuenta personal, la cantidad de 16 millones 791 mil 538 pesos, propiedad de la Universidad Autónoma de Nayarit, sin que se acrediten fines institucionales, ello también, durante el ejercicio fiscal 2016. El agente del Ministerio Público encargado de la Causa Penal 1121/18, expuso los datos de prueba suficientes para que la autoridad judicial concediera el auto de Vinculación a Proceso, en contra de los dos imputados, fijando un plazo de seis meses para la investigación complementaria.