Uno de los retos más grandes que afronta la Universidad Autónoma de Nayarit son las 24 mil horas no reconocidas ante la Secretaría de Educación Pública, es por eso que una gran cantidad del recurso propio se va para el pago de estos maestros, desestabilizando la economía de la máxima casa de estudios.
"También se analizó que el número de profesores que tiene reconocido la dirección general no es acorde a la necesidad que tiene la universidad, por eso se habla de profesores de tiempo completo no reconocidos y por eso se habla de horas de asignatura no reconocida, te doy un dato, tienen reconocidas, se da presupuesto para 9 mil horas de asignaturas cuando las que ellos tienen detectadas que se deberían dar es para 35 mil horas." - Francisco Haro, Secretario Genera del SPAUAN