Desde el 2021 la Auditoría Superior de Nayarit notificó como irregular la administración y la impartición de educación básica al interior de la Universidad Autónoma de Nayarit, estando totalmente fuera de sus facultades y atribuciones la operación de un preescolar, una primario y una secundaria, mismas que generan un gasto anual a la máxima casa de estudios de 44 mdp, así lo dio a conocer el titular de la ASEN Salvador Cabera.
"Si no más no recuerdo hablábamos de cerca de 44 millones de pesos anual que es lo señalado que es el dinero que se daba por parte de la universidad como subsidios, que incluía: sueldos, gastos, recordemos que la universidad aportaba recurso y la administración de los cendis era llevado a cabo por los administradores."