La inversión requerida para la construcción del Tren Maya será de 139 mil 100 millones de pesos y tendrá una rentabilidad de 206.6 mil millones de pesos, según el Fondo Nacional del Fomento al Turismo (Fonatur). El monto de inversión será para el proyecto ejecutivo, material rodante, túneles, viaductos, liberación de derechos de vía, supervisión del proyecto, etc, de acuerdo con el documento "Análisis costo beneficio, versión pública", difundido por Fonatur.