La plantación de agave provocará que haya crecimiento de la frontera agrícola, los productores de frutillas tendrán que migrar, para poder impulsar dichos plantíos, además de la erosión de los suelos, la salinización y la pérdida de fertilidad de la tierra. La contaminación, la deforestacion, el problema de aguas residuales y las efectos al medio ambiente, son algunos de los problemas que se generan a corto y mediano plazo con el agave, también estará restando superficie para la siembra de granos básicos. Por lo anterior, investigadores y ambientalistas se encuentran preocupados por los impactos negativos a la cuenca del Río Duero, esperan que se inviertan recursos para el saneamiento a través de la construcción de las plantas de tratamiento que el Gobierno del Estado se comprometió a instalar. "El agave como tal tiene un manejo de que le estorba la vegetación alrededor, va eliminar la biodiversidad y requiere también suelos pedregosos, entonces se van a ir hacia los cerros".. Informó el profesor investigador titular del Colegio de posgraduados, José Luis Pimentel Equihua.